環磷酰胺是治療重症紅斑狼瘡的有效的藥物之一，尤其是在狼瘡性腎炎和血管炎的病人中，環磷酰胺與激素聯合治療能有效地誘導疾病緩解，阻止和逆轉病變的發展，改善遠期預後。其治療方案爲激素+環磷酰胺是Ⅳ型LN，治療紅斑狼瘡的激素稱爲糖皮質激素，是由腎上腺皮質分泌的。
目前普遍採用的標準環磷酰胺衝擊療法是：0.5～1.0g／m2體表面積，加人生理鹽水中靜脈滴注，每月1-2次。多數病人6～12個月（大致總量在6-8克）纔可以起到效果。由於各人對環磷酰胺的敏感性存在個體差異，年齡、病情、病程和體質使其對藥物的耐受性有所區別，所以治療時應根據病人的具體情況，掌握好劑量、衝擊間隔期和療程。用藥期間應密切注意血象監測，避免導致白細胞過低。
由此可以看出，環磷酰胺要打6-12個月，總量在6-8克才能起到效果，所以提醒紅斑狼瘡患者，要不就不用環磷酰胺，要用就堅持到底。如果不能堅持到，就停止使用，那和沒用是一樣的，因爲它需要一個累積量（總量6-8克）。
