乙型肝炎母嬰傳播宮內感染如何診斷?對HBV宮內感染診斷指標尚未統一，因此無法準確判斷新生兒感染的時間。
目前普遍接受2001年第二屆“阻斷HBV母嬰傳播和乙型肝炎免疫與臨牀應用學術會議紀要”提出的HBV宮內感染定義：HBsAg(+)母親的新生兒出生時從其外周靜脈採血測到乙肝病毒複製標誌物的存在，採用主動+被動聯合免疫進行母嬰阻斷後無免疫效果者，乙肝病毒複製標誌物持續陽性至少3個月以上。
另外，也有人採用《乙型肝炎基礎和臨牀》(第二版)中提出的診斷標準：HBsAg(+)母親的新生兒出生時從其外周靜脈採血測到乙肝病毒複製標誌物或HBsAg;且在以後複查中，1月齡檢測HBsAg陽性爲宮內感染的初篩診斷標準，6月齡檢測HBsAg仍爲陽性爲確診標準。
但是近些年來發現，這種診斷標準常常會漏掉許多因宮內感染所致的母嬰傳播阻斷失敗的病例。這是因爲部分新生兒雖然在子宮內已被母親的乙肝病毒感染，但血清學感染標誌卻表現爲陰性，形成所謂的乙肝病毒“潛隱性狀態”。
由於胎兒免疫系統尚未成熟，肝細胞也未充分發育，儘管胎兒在子宮內已經感染了乙肝病毒，但乙肝病毒的複製能力較低，對HBsAg的表達水平也較低;再加上新生兒出生時立即注射了乙肝免疫球蛋白，而來自母血的抗-HBcIgG也可抑制胎兒HBsAg表達和產生有效的免疫反應。所以，有些乙肝病毒宮內感染的新生兒，尤其是臨近分娩期的宮內感染，常常表現爲HBsAg或/和HBV DNA的“假陰性”，被醫生們稱爲乙肝病毒“潛隱性狀態”。
這種“潛隱性狀態”一般持續1～3個月，隨着新生兒肝細胞發育逐漸成熟，乙肝免疫球蛋白和來自母血的抗-HBcIgG滴度下降，“潛隱性狀態”的乙肝病毒開始複製和表達，HBsAg和HBV DNA才逐漸轉爲陽性。
