許多乙型肝炎患者對長期的抗病毒治療無心理準備，以爲乙型肝炎會很快治癒。所以常常表現爲治療的依從性差，不能堅持治療。
我國《慢性乙型肝炎防治指南》提出的乙型肝炎患者治療的總體目標是：最大限度地長期抑制HBV，減輕肝細胞炎症壞死及肝纖維化，延緩和減少肝臟失代償、肝硬化、肝細胞癌及其併發症的發生，從而改善生活質量和延長存活時間。
因此，乙型肝炎的抗病毒治療是長期的。干擾素只能對部分病人有效，大多數患者需要長期服藥治療。治療的短期目標是有效地抑制HBV複製，使肝臟的炎症、壞死和纖維化得到改善;長期目的的達到HBeAg的血清學轉換，最終達到HBsAg消失的目的。
但是，長期目標絕不可能短期實現，需要堅持長期有效的抗病毒治療，往往需要幾年或十幾年的努力才能達到。
