中醫治療鼠疫首先要區分鼠疫的類型，腺鼠疫需清熱解表，消腫解毒。肺鼠疫需清熱解毒，涼血止血。敗血型鼠疫治療是涼血、清營解毒。根據病情、疾病類型，對症治療。
一、腺鼠疫治療
腺鼠疫主要症狀是寒顫高熱、臉部發紅、口渴、神識模糊等，而觀察舌苔也會發黃。中藥可用黃芩、連翹、板藍根、元參、黃連、薄荷、赤芍、夏枯草、生甘草等治療。
二、肺鼠疫
肺鼠疫主要有高熱煩渴、咳嗽呼吸受阻、咳血等表現，主要是清熱解毒，涼血止血治療。可用生石膏、水牛角、生地、黃連、丹皮、知母、半夏、仙鶴草、全瓜蔞等來治療，用藥量需要根據病情決定。
三、敗血型鼠疫
主要表現爲便血尿血、肢體發冷、面色發白，需涼血、清營解毒。淡竹葉、丹皮、生地、白茅根、元參、黃連、生石膏、紫草、側柏葉等藥物很起作用。
