慢性非细菌性前列腺炎是最常见的前列腺炎，其病因十分复杂，主要病因多是病原体感染、炎症和异常的盆底神经肌肉活动和免疫异常等共同作用结果。
1）病原体感染
非细菌性前列腺炎患者虽然常规细菌检查未能分离出病原体，但可能仍然与某些特殊病原体有关，如患者受某些特殊病原体如厌氧菌、L型变形菌、纳米细菌、或沙眼衣原体、支原体等感染。
2）排尿功能障碍
尿道出口梗阻等原因造成的残余尿会造成尿液反流入前列腺，不仅可将病原体带入前列腺，也可直接刺激前列腺，诱发无菌的前列腺炎。
3）精神心理因素
人的精神状态、心理因素也是很多疾病的诱因。当今社会的生活压力很大，焦虑、烦躁、压抑、精神紧张等负面情绪和心理因素都可能会引起内分泌失调和神经功能紊乱，这些都可能引起或促进前列腺炎的形成。
4）免疫因素、氧化应激也对前列腺有影响，个人身体免疫能力的高低、氧自由基的产生的多少、自由基的清除体系作用大小，都关系到前列腺炎的发生和发生程度。
5）盆腔相关疾病因素
间质性膀胱炎是可能的病因，前列腺外周带静脉丛扩张、痔、精索静脉曲张等是造成慢性非细菌性前列腺炎发生或久治不愈的原因。
