乙型肝炎進入晚期後，會出現各種惡性乙型肝炎的症狀，肝硬化，食慾不振，全身無力，稍微動一動就會感到疲勞，腹瀉嚴重，肝昏迷和肝性腦病也有可能伴隨。
乙型肝炎的病情到了末期後，隨着肝功能損傷的加重，蜘蛛痣的數量增加，肝功能減退時，肝對醛固酮和抗利尿激素的絕作用減弱，繼發性醛固酮增加，抗利尿激素增加。前者作用於遠端腎小管，增加鈉重吸收，後者作用於集合管，增加水的吸收。鈉水積存可以減少尿量和水腫，對腹水的形成和加重起到至關重要的促進作用，由於腎上腺皮質功能減退，患者的臉部（尤其是眼眶周圍）和其他暴露部位，可見皮膚色素沉穩。
乙型肝炎晚期的症狀也表現為腹水的出現，腹水後腹壁緊張增加，患者直立時下腹充實，仰卧時腹部兩側膨脹為青蛙狀腹狀。大量腹水使腹壓升高時，臍部受壓形成臍疝。診斷有移動性濁音，大量腹水時液波顫抖。大量腹水使橫膈肌升高和運動受到限制，可產生呼吸困難和心悸。腹水壓迫下腔靜脈可引起腎臟淤血和下肢水腫。部分患者由於大量腹水使腹壓升高，腹水通過橫膈膜變薄的孔道和胸膜淋巴漏入胸腔，可產生胸水，此時一般也標誌着肝硬化進入失代償期，是晚期乙型肝炎惡化的表現。
如果乙型肝炎患者出現以上症狀，乙型肝炎可能進入晚期，乙型肝炎晚期症狀出現後更加重視，立即在大型正規肝病醫院接受治療，防止病情惡化。
