腸結核初期最常見症狀是腹痛，患者排便習慣也會發生改變，增生性腸結核患者腹部還會有腫塊。此外會出現一些全身性症狀。
1、腹痛
通常是臍周或右下腹隱痛。每次吃完飯後疼痛的症狀會加重，排便或排氣後疼痛會有所緩解，常常伴隨腸鳴。
2、排便習慣改變
潰瘍型腸結核，通常有腹瀉症狀，糞便多呈糊狀，並沒有膿血及裏急後重情況，有時可表現為腹瀉與便祕交替。增生性腸結核最常見症狀是便祕。
3、腹部有腫塊
這種情況多見於增生性腸結核，腫塊位置一般都是在右下腹，而且位置比較固定，並不會出現移動情況。按壓腫塊會有輕度至中度壓痛。
4、全身症狀
腸結核發病初期有可能出現一些全身性症狀，比如午飯後出現低熱現象，有些人還會伴隨盜汗。
