前列腺囊腫的病因有很多，相對來說比較複雜，而也正是因為病因的不同，導致前列腺囊腫分為多種不同的型別，無論是在前列腺囊腫的治療上，還是預防上，病因都是一個重點，下面就前列腺囊腫的病因進行總結:
(1)真性前列腺囊腫:前列腺腺體在胚胎髮育期內受到障礙，引起前列腺導管狹窄，造成阻塞，內容物逐漸瀦留而形成，故屬於瀦留性前列腺囊腫.
(2)先天性囊腫:為中腎導管與中腎旁管發育異常，管腔部分擴張而形成囊腫.起於中腎旁管的囊腫常位於前列腺後正中處，而起自中腎導管的囊腫則居於兩旁.這種囊腫實際並非起自前列腺，常與膀胱後壁粘連.其體積往往可長到很大，壓迫膀胱頸引起排尿困難;壓迫直腸引起肛門墜脹感與排便困難.先天性前列腺囊腫常伴有尿道下裂、隱睪、腎發育不全等先天性疾病.
(3)後天性囊腫:系由堅韌的前列腺基質導致腺泡不完全或間斷性梗阻，逐漸使腺泡上皮變厚，終至發生瀦留性囊腫，可位於前列腺內的任何部位或突出至膀胱頸部，直徑為1—2cm.
(4)炎症性囊腫:系前列腺慢性炎症引起結締組織增生，導致前列腺導管狹窄，分泌物瀦留形成囊腫.
(5)寄生蟲性囊腫:由於寄生蟲引起，如包蟲能使前列腺管及周圍發生慢性炎症，或由肉芽增生，逐漸形成囊腫.
需要注意的是，有幾種型別的前列腺囊腫具有傳染，以及遺傳的特點，這也是前列腺囊腫型別中傷害最大的，包括寄生蟲性前列腺囊腫，以及炎症性前列腺囊腫，這兩種型別的囊腫需要及時治療，並且注意避免傳染。
