HPV用藥三個月後是否可以同房，需視用藥情況而定，如還在用藥期間應暫緩同房，以免降低治療效果。
HPV陽性無其他症狀時，一般暫時無需用藥，可等待免疫系統自行清除HPV。如患者有陰道分泌物增多、接觸性出血等表現時，可能會應用抗病毒的藥物外用、內服治療。在用藥期間儘量避免同房，否則會使接觸性出血等不適症狀加重，影響藥物的治療效果，導致HPV轉陰速度減慢。
目前沒有治療HPV的特效藥，即使應用抗病毒的藥物治療，也無法徹底清除HPV，但長期用藥副作用較大，通常會在用藥三個月左右停藥。如患者已經停藥後，通常可以同房。但停藥並不意味著HPV轉陰，如複查結果顯示HPV還呈陽性，應減少同房次數，同房前還需清洗外生殖器，同房時全程帶套，防止出現交叉感染。即使HPV轉陰，半年內不可備孕，同房時要做好避孕措施。
