男性生殖器官分為外生殖器官和內生殖器官兩部分。外生殖器包括陰阜、陰囊和陰莖，內生殖器包括睪丸、睪丸、精索、輸精管和射精管、精囊腺、前列腺、尿道球腺、尿道等。
①外生殖器官
陰阜是恥骨前方的面板和豐富的皮下脂肪組織。青壯年時陰阜明顯隆起，中年後脂肪組織減少陷落，老年人萎縮變平。
陰囊是由面板、肌肉等組成的柔軟有彈性的袋狀袋，其中有睪丸、睪丸、精索，主要功能是保護睪丸、調節溫度、有利於精子的產生和貯藏等。陰囊內有陰囊隔離，陰囊內腔分為左右兩部分，各容納睪丸和睪丸。陰囊面板薄而柔軟，皺紋多。陰囊面板有明顯的色素沉著，有稀疏的陰毛。
陰莖後部為陰莖根，中部為圓柱形陰莖體，其前端膨脹大部分為陰莖頭(通稱龜頭)。陰莖軸和陰莖頭之間是冠狀溝，陰莖頭和冠狀溝含有豐富的神經末梢，刺激敏感，冠狀溝神經分佈最豐富，敏感性最高。陰莖體由陰莖海綿體和尿道海綿體組成，具有豐富的血管、神經和淋巴管。從外形上看，陰莖有鬆弛和勃起兩種狀態，具有排尿、性交、射精三大功能。
②內生殖器官
睪丸為男性生殖腺，卵圓形，左右各一根，用精索懸掛在陰囊內，長約4~5釐米，厚約3~4釐米，重約15克。睪丸是產生男性生殖細胞(精子)的器官，也是產生男性荷爾蒙的主要內分泌腺體。
附睪位於睪丸的後外側，形狀細長，半月形，左右各1釐米，長約5釐米。睪丸具有儲存和排出精子、促進精子成熟和提供精子營養的作用。
精索位於睪丸上端至腹股溝管腹環之間，左右各一個，全長約14釐米。精索是睪丸、睪丸、輸精管血液、淋巴液迴圈的通道，也是保證睪丸生精功能和成熟精子運輸的主要途徑。輸精管是精索內的主要結構之一，其末端與精囊腺排洩管匯合成射精管，穿過前列腺，開口於尿道，總長約40~46釐米，直徑約2~3毫米。輸精管是精子從睪丸輸送到前列腺尿道的唯一途徑。射精管是輸精管壺腹與精囊管結合後的繼續。射精管短，長約2釐米，管壁薄。
精囊腺為一對扁平長囊狀腺體，左右各一對，表面凹凸不平呈結節狀，其末端細為精囊腺排洩管，與輸精管末端匯合成射精管，尿道前列腺部開口於尿道。精囊長4-5釐米，寬約2釐米，容積約4毫升。精囊為屈曲狀的腺囊，其分泌液主要為精漿液，佔精液的70%左右，對精子的存活有重要作用。前列腺為一個栗子狀的腺體，平均重量約20克，是男性最大的附屬腺體，能分泌前列腺液，組成精漿液。前列腺還被認為是一個性敏感部位，對其進行適當刺激時，可以引起性興奮。尿道球腺左右各一，位於尿道生殖隔上下筋膜之間的會陰深囊內，開口於球部尿道近端，可分泌少量液體，為精漿的成分之一。
男性尿道長12-20釐米，既有排尿功能，又有排精功能。其中有尿道球腺，可分泌液體，參與精液的組成，性交時有潤滑陰莖頭的作用。
