巧克力囊腫絕大多數是由子宮內膜異位症所引發的，很多女性都不知道這種疾病的嚴重性，沒有引起重視，而使得病情越發嚴重。
1、巧克力囊腫是一種腫塊，這種疾病多發於30-40歲的女性。在正常的情況下，子宮內膜都是處於宮腔裏，受女性生理因素的影響，會以每月爲一個週期出現脫落，從而形成月經。而女性在月經期所脫落的子宮內膜碎片，進入到了盆腔，就很可能停留在卵巢以及盆腔的其它位置，進而出現異位囊腫。這種囊腫會隨着月經的週期，而出現反覆出血的情況。
2、女性體內出現了巧克力囊腫，不僅會給患者帶來巨大的痛苦，還會影響到卵巢和輸卵管的正常功能，使女性不孕。囊腫的周圍組織也會受到影響，如果靠近腸胃，就會引起腹瀉以及腸胃疼痛。
