體溫計的測量位置也是有一定的講究的，不同的測量位置有不同的注意事項。
口腔溫度的採集是藉由病患將溫度計正確且安全的放置到口腔的能力。也就是排除了小孩或是無力抵抗咳嗽、虛弱的人或是會嘔吐的人。（這在反應快速的電子式溫度計來說比較沒有問題，但在水銀式溫度計中就是一個重要的課題，因爲水銀式溫度計需要長的時間來反應溫度）其他應該注意的地方是，當病患在使用口腔式溫度計前如果有飲用熱飲或是冰飲，那就必須考量其他的溫度測量方法。
直腸：在直腸溫度的量測時，特別是由另一人來量測時，應該要使用潤滑劑來幫助。雖然直腸溫度最爲準確，但是要考量這樣的行爲在某些國家或是文化中是令人難爲情的。另外如果置入溫度計的方式不正確則會讓病人感到不舒服甚至疼痛。嬰兒通常都使用直腸溫度量測，然而還是要藉由護士來操作比較妥當。
耳內或是前額：另外有利用紅外線量測技術量測耳內鼓膜的耳內溫度計以及量測前額的前額溫度計。
腋下：使用前先將體溫計的水銀汞柱甩到35℃以下。將體溫計水銀端放在腋下最頂端（即腋窩深處），用上臂將體溫計夾緊，以免脫位或掉落；測量5—10分鐘；取出體溫計，讀取溫度數據後，用衛生紙擦拭體溫計，以便下次或他人使用。
讀數方法：一手拿住體溫計尾部，即遠離水銀柱的一端，使眼與體溫計保持同一水平，然後慢慢地轉動體溫計，從正面看到很粗的水銀柱時就可讀出相應的溫度值。讀數時注意千萬不要用手碰體溫計的水銀端，這樣會影響水銀柱而造成測量不準。
注意事項：
1、腋下如有汗液，需擦乾再量。
2、若測量時間未到，鬆開腋下，則需重新測量，時間應重新計算。
3、在測量體溫前凡影響實際體溫的因素（如飲開水或冷飲等）均應避免，喝熱飲、劇烈運動、情緒激動及洗澡需待30分鐘後再測量。
4、玻璃體溫計最高溫度值是42℃，因此在保管或清潔時溫度不可超過42℃，不可將體溫計放入熱水中清洗或用於測量水及其他物體的溫度。
特別注意事項：玻璃體溫計易破碎，存在水銀（汞）污染的可能。
