腦出血開顱手術的風險較大，可能出現麻醉風險、顱內大出血、顱內感染等危害，有致命風險。
任何手術都有風險，爲腦出血患者做開顱手術的風險相對更大一些。首先可能出現麻醉風險，如患者對麻藥過敏，在麻醉過程中出現血壓下降、心律紊亂等表現，有可能會有致命的風險。
其次開顱手術有創傷、出血，爲腦出血患者做手術時，可能使手術區域再次出血。出血量較大時，致殘和致死風險增加。因腦動脈瘤破裂引起腦出血，做開顱手術清除血腫時，有可能會使動脈瘤再次破裂，引起大出血，很可能使呼吸、心跳驟停，導致患者死亡。
另外，做開顱手術後護理不當，可能引起顱內感染，不但使患者有發燒、頭痛、精神異常表現，嚴重時還可能導致顱內壓升高，如顱壓持續增高常會引起腦疝，也有致命風險。
