做胃鏡通常掛消化內科，如醫院科室設置不詳細，建議去內科掛號，大內科通常包含消化科。如已明確胃腸道疾病，需做進一步治療，做胃鏡檢查可掛胃腸外科，醫院科室設置不明細一般掛普外科。
胃鏡是上消化道病變常用的檢查方法，可直接觀察食道、胃部及十二指腸的病變。如經常感覺胃部不舒服，或本身就患有慢性胃炎、胃潰瘍、十二指腸潰瘍等疾病，應定期去醫院進行胃鏡檢查。那做胃鏡掛什麼科室？
胃鏡主要用於檢查胃部、食道及十二指腸等部位的病變，因此應去消化內科掛號就診。當患有慢性胃炎、消化性潰瘍，或出現燒心、反酸及胃部脹滿等胃部不適症狀，進一步明確診斷應去消化內科做胃鏡檢查。胃鏡分爲普通胃鏡和無痛胃鏡，普通胃鏡有一定的痛苦性，可導致腹脹、噁心及乾嘔等症狀。如患者感覺恐懼或反應較大，建議選擇無痛胃鏡。
如醫院規模不大，科室設置並不詳細，未設置專門的消化內科，可直接去內科掛號，因爲大內科也包含消化科，可進行消化系統的相關檢查，包括胃鏡檢查。檢查胃鏡前要求空腹，至少8個小時不可吃飯喝水，以免影響檢查結果。
如已明確患有胃息肉、消化性潰瘍、上消化道腫瘤及消化道出血等疾病，需做進一步治療，應去胃腸外科就診。治療前通常先進行胃鏡等相關檢查，明確胃部的具體病情，部分疾病可在胃鏡下進行治療。
有些縣級醫院或地方小醫院分科不明細，無專門的胃腸外科，建議直接去普外科掛號就診。在普外科也可進行胃鏡檢查及相關治療。
