扁桃體化膿留下的坑多半都能恢復。這種損傷是可逆的，而且黏膜組織可以自我修復。
扁桃體是位於口咽部兩側的扁桃體窩內的組織，屬於淋巴組織，包含了大量的淋巴濾泡以及結締組織網。這樣的組織表面本身就會有坑坑窪窪的現象，被稱爲扁桃體小窩。當扁桃體化膿後，在炎症刺激之下，局部組織會受到一定程度的損傷，部分人病情痊癒後，扁桃體部位的小窩會變得比較深，這種情況通常是可以恢復的。
因爲化膿造成的局部損傷並不是完全不可逆的損傷，而且扁桃體部位的黏膜有自動修復的功效，所以扁桃體化膿留下的坑能隨着時間的推移而逐漸恢復。但由於扁桃體表面本來就是坑坑窪窪的，所以並不能完全恢復至平滑的狀態。平時可以多喝些溫開水，用適量的淡鹽水漱口，換季時要注意適當增加衣物，防止着涼感冒，預防扁桃體再次化膿。
