大多數病毒性心肌炎可治好，患病後積極進行抗病毒、抗心律失常、改善心肌代謝治療等，可緩解或治癒疾病；如病情嚴重出現爆發性心肌炎、重症心肌炎，治癒率低，死亡率高。
病毒性心肌炎病情較輕時，積極配合醫生治療，基本上可徹底治癒疾病；若病毒性心肌炎嚴重，出現爆發性心肌炎、重症心肌炎，病情進展快，治療不及時死亡率高；即使積極治療，也可伴隨心力衰竭、心律失常等併發症，治癒難度增加。
出現病毒性心肌炎時，首先可用干擾素抗病毒，緩解病情；還可應用免疫強抑制劑進行免疫調劑，減輕心肌損害。出現病毒性心肌炎時，常會伴隨心律失常問題，此時可應用抗心律失常藥物治療。用脂溶性維生素等藥物改善心肌能量代謝，促進受損細胞修復，緩解病情。
