急性扁桃體炎反覆發作較爲嚴重，可引起局部併發症、睡眠呼吸障礙、吞嚥困難、全身性的併發症。
1、局部併發症
急性炎症刺激扁桃體可引起咽喉膿腫，累及耳部、呼吸道，常合併中耳炎、急性支氣管炎、肺炎等其他併發症。
2、睡眠呼吸障礙
急性扁桃體炎未及時治療可引起扁桃體肥大，而扁桃體肥大會影響患者正常睡眠，誘發睡眠時呼吸障礙。尤其是兒童人羣，可造成大腦缺氧，影響身體、智力發育。
3、吞嚥困難
急性扁桃體炎可造成咽喉疼痛，影響正常僅進食。食慾不振、嘔吐、高熱、抽搐等症狀隨即發生。
4、全身性併發症
急性扁桃體炎耽誤治療，炎症持續性加重，常合併急性心肌炎、心包炎、風溼性關節炎等全身性併發症。
