確診直腸息肉的四步檢查都是直腸指檢、電子肛腸鏡檢、乙狀結腸鏡或纖維鏡檢、鋇灌腸可顯示充盈缺損。
1.直腸指檢：表現爲直腸中、下段的息肉，直腸息肉用手指檢測可觸及柔軟、光滑、活動的結節。患者直腸指診可觸及質軟如豆粒大小的圓形腫物，能活動，無壓痛。並且直腸息肉的位置較高或較小的息肉，直腸指診不易發現，需做其他輔助檢查。
2.電子肛腸鏡檢：能更加精確地診斷，增生性息肉多呈丘狀隆起結節。腺瘤性息肉呈圓形，表面黏膜淡紅並且有光澤。絨毛乳頭狀腺瘤爲分葉狀，形似菜花，軟如海綿的大息肉。炎性息肉蒂長色紅。解決了肛腸病檢測漏診、誤診問題。
3.乙狀結腸鏡或纖維鏡檢：若發現多個息肉時，大腸腸腔內各種病變的常規診斷及檢，作乙狀結腸鏡或纖維鏡檢，排除多發息肉及結腸息肉病。纖維內鏡配有標準型活鉗取樣器械，有助於發現結腸內的早期病變。
4.鋇灌腸：可顯示充盈缺損。
