(一)病因
原發性低磷酸鹽血癥性佝僂病的病因主要與遺傳有關。本病是一種性連鎖顯性遺傳病。遺傳缺陷異常因素主要發生在X染色體或常染色體隱性遺傳上。患者通常有家族史。有些是散發性患者，病因不明，可能是這些患者身體各個部位的一些間質腫瘤。
(二)發病機制
這種疾病的發病機制尚不完全明確，過去被認為是維生素D代謝異常或腸道鈣吸收障礙引起的，但血液1、25(OH)2D3.水平正常，不能糾正低血磷和尿磷排出過高，證據不足。目前認為腎小管本身有功能缺陷，可能缺乏磷結合蛋白，影響腸腎小管上皮磷的正常轉移。一般認為遺傳者可能是磷轉運系統，對甲狀旁腺素有特殊的遺傳缺陷，合成1、25(OH)膽骨化醇功能障礙，腎小管對磷的吸收減少，尿磷增多，導致血磷下降。由於腸道對鈣的吸收減少，血液(Ca)×(p)骨鈣化的聚減少，導致低鈣血癥、繼發性甲狀旁腺功能亢進和骨鈣化功能不全，導致佝僂病或骨軟化。鉅細胞腫瘤(良性或惡性)、修復性肉芽腫、血管瘤、纖維瘤等繼發性疾病可能會損害近端腎小管25(OH)D的1α-羥化和磷酸鹽的轉移增加了腎磷酸鹽的去除，導致骨軟化和低磷酸鹽血癥。在上述因素的影響下，最終導致生長髮育障礙和明顯骨病。
