判斷是不是自免肝時，需通過臨牀症狀與超聲、CT、磁共振等影像學檢查，並與肝膽腫瘤、結石等疾病進行鑑別。
自免肝起病緩慢，在發病初期，部分患者無任何症狀。部分患者在病變活動期有渾身無力、腹脹、食慾減退、皮膚瘙癢、黃疸、肝脾腫大、蜘蛛痣、周圍性水腫等表現。部分女性還會出現牙齦出血、鼻出血、痤瘡、多毛、閉經等症狀。懷疑出現自免肝時，可到醫院進行相關檢查。如進行肝生化檢查，可看到谷丙轉氨酶、穀草轉氨酶輕度、中度升高。進行免疫學檢查，患者血清中可檢查到抗核抗體、抗平滑肌抗體等。患者可以在醫生的指導下使用硫唑嘌呤片等潑尼鬆龍片藥物進行治療。
