一般情況下，中醫治療肛瘻主要採用濕毒清熱法、補土除濕法、中藥薰洗法等方法治療。具體內容如下：
1、濕毒清熱法：肛瘻多是脾胃虛弱、濕熱下注、大腸燥熱等原因，導致的濕熱滯積，血瘀毒邪內結而成的。患者可以遵醫囑使用枳殼、黃連、黃芩、大黃等清熱解毒的中藥，也可以使用魚腥草、苦蔘、皂角刺等有祛濕和殺菌作用的中藥，以飲片、藥膏等方式內外服用，從而達到清熱解毒和疏通脾胃的作用。
2、補土除濕法：口服黨蔘、白朮、茯苓等温中健脾、祛濕化瘀的中藥，外用如蜂膠、黃連粉、鮮竹葉等，可以起到鎮痛、消炎、癒合肛瘻的作用。
3、中藥薰洗法：採用中藥煎湯，然後通過薰洗肛門的方式，以温熱燻蒸和消炎殺菌的作用來促進創面癒合，常用的有白蜜、黃連、草果、杜仲等藥材。但是需遵醫囑用藥。
除了以上方法外，還有其他的治療方式，比如鍼灸治療、水療法治療、推拿按摩治療。同時還應注意日常飲食衞生和生活習慣的調整。病情較為嚴重的患者，建議及時到正規醫療機構就醫。
