過山洞耳朵不舒服是因外界壓力和中耳內部壓力失去平衡，或因咽鼓管功能異常所致。
中耳是通過咽鼓管結構和鼻咽部進行連通，在過山洞、隧道時，耳朵內外氣壓會隨之改變，外界壓力會將鼓膜壓向中耳腔，當中耳與外界壓力不平衡時，咽鼓管可以打開，調節外界的壓力保持平衡，所以導致耳朵出現聽力下降、悶脹感。
本身咽鼓功能較差，患有炎症疾病者，更易出現耳朵悶堵症狀，一般在做吞嚥動作，或嚼口香糖時可以緩解。若出山洞後，耳朵悶堵症狀持續幾天仍未緩解，需進行聽力和耳壓檢查，確定有無炎症影響，並考慮應用消炎藥物、促排類藥物緩解，如地塞米松、紅黴素、頭孢唑肟類抗生素，或應用氧氟沙星滴耳液、過氧化氫溶液類藥物。
