慢性前列腺炎的病因很複雜，而且要看到底是哪種慢性前列腺炎。慢性細菌性前列腺炎主要爲病原體感染，以逆行感染爲主。非細菌性前列腺炎是多種複雜的原因和誘因引起的炎症、免疫、神經內分泌參與的錯綜的病理變化，導致以尿道刺激症狀和慢性盆腔疼痛爲主要臨牀表現，患者通常還會有精神和心理上的症狀。
1、慢性細菌性前列腺炎
這種慢性前列腺炎的主要致病因素爲病原體感染，病原體主要爲葡萄球菌屬，其次爲大腸埃希菌、棒狀桿菌屬及腸球菌屬等。前列腺結石和尿液反流可能是病原體持續存在和感染復發的重要原因。
2、慢性非細菌性前列腺炎
這種慢性前列腺炎的病因比較複雜，很可能是病原體感染、炎症和異常的盆底神經肌肉活動和免疫異常等共同作用的結果。
（1）病原體感染
臨牀某些以慢性炎症爲主、反覆發作或加重的“無菌性”前列腺炎，可能與這些病原體有關，如厭氧菌、L型變形菌、納米細菌、或沙眼衣原體、支原體感染。其他病原體如寄生蟲、真菌、病毒、滴蟲、結核分枝桿菌等也可能是該型的重要致病因素。
（2）排尿功能障礙
某些因素引起尿道括約肌過度收縮，導致膀胱出口梗阻與殘餘尿形成，造成尿液反流入前列腺，不僅可將病原體帶入前列腺，也可直接刺激前列腺，誘發無菌的“化學性前列腺炎”。
（3）神經內分泌因素
前列腺痛患者往往容易發生心率和血壓的波動，表明可能與自主神經反應有關。
（4）盆腔相關疾病因素
部分前列腺炎患者常伴有前列腺外周帶靜脈叢擴張、痔、精索靜脈曲張等，提示部分慢性前列腺炎患者的症狀可能與盆腔靜脈充血，血液於滯相關，這也可能是造成久治不愈的原因之一。
（5）精神心理因素
經久不愈的前列腺炎患者中一半以上存在明顯的精神心理因素和人格特徵改變。如：焦慮、壓抑、疑病症、癔病，甚至自殺傾向。這些精神、心理因素的變化可間接進一步加重症狀，消除精神緊張可使症狀緩解或痊癒。但目前還不清楚精神心理改變是其直接原因，還是繼發表現。
