寶寶吃奶粉會出現腹瀉的情況，最常見的就是由牛奶過敏和乳糖不耐受引起的。如果確認嬰兒是因牛奶蛋白或乳糖不耐受而引起的腹瀉，可直接停用原配方奶粉，更換成腹瀉奶粉，待腹瀉改善後，則需以漸進式添加配方奶粉方式進行換奶，儘量不要“今天吃腹瀉奶粉，明天一下就換正常寶寶奶粉”。
防腹瀉奶粉是一種特殊的嬰兒配方奶粉，適用於少數先天對牛奶蛋白或乳糖過敏、因乳糖無法耐受而引起腹瀉的嬰兒，通常選擇兩類防腹瀉奶粉，一是無乳糖配方，二是豆奶粉，需要提醒的是，嬰兒配方豆奶粉雖採用的是大豆原料，不含乳糖。但並非所有豆奶粉都適合乳糖不耐受寶寶食用。
爲寶寶挑選配方奶粉時，應避免含有棕櫚油、全脂奶粉或乳脂等成份的嬰幼兒配方奶粉，儘量選用精製植物油配方，寶寶喝了不上火、不便祕，對鈣質和脂肪的吸收會更好，這樣纔有助於嬰幼兒骨骼發育和能量的吸收。
控制寶寶飲食中棕櫚油酸和硬脂酸很重要，寶寶便祕是因爲糞便過硬，而這是由於糞便中的不溶物質引起的，此不溶物質主要來自腸道中不能吸收的棕櫚酸和硬脂酸結合鈣質形成鈣皁所致。因此，如果寶寶奶粉中含有較多的棕櫚油酸和硬脂酸，排便便會較硬。
