低燒不能打新冠疫苗第二針，否則會影響疫苗的效果，也會使發熱症狀加重，掩蓋疫苗的不良反應。
雖然低燒的發生與多種因素有關，但仍在發燒時，身體免疫力和抗病能力會有所下降，若在這種情況下接種第二針新冠疫苗，可能會影響機體產生相應的保護性抗體，導致接種失敗。部分人還會因爲接種疫苗而造成發熱程度加重或難以緩解，誘發其他的身體不適。如果發低燒是因爲新冠肺炎引起，更不建議接種相關疫苗，因爲新冠疫苗不具有治療新冠肺炎的作用。
部分人接種完疫苗後可能會出現發熱和乏力等不良反應，若在發低燒的情況下接種相關疫苗，容易將疫苗出現的不良反應掩蓋或與之混淆，不利於不良反應的及時發現與治療。對於發低燒的患者，應積極進行相應的檢查，明確發熱的病因，等到熱退、疾病緩解痊癒一週以後，再根據具體情況考慮接種新冠疫苗。
