高錳酸鉀是強氧化劑，可以殺滅細菌。在婦科方面，0.01%的高錳酸鉀水溶液可以用於陰道沖洗;0.02%的水溶液用於坐浴，治療白帶過多;蜜月之中，用0.05%的水溶液清洗外陰，可預防泌尿系統感染。女性痔瘡的發生率較高，用0.1%的水溶液坐盆浸泡，可止癢止痛、防止感染，促進脫出的痔核復位。
有些婦女以爲高錳酸鉀消毒殺菌作用強，就經常用來清洗外陰。其實，這樣做對健康反而不利。正常情況下，婦女陰道內生存着大量對人有益的陰道桿菌，能將陰道內表皮細胞中貯存的糖原分解成乳酸，以保持陰道內的酸度，形成一道能夠防止致病菌在道陰內繁殖的天然屏障。如果經常使用高錳酸鉀沖洗陰道，會使大量的陰道桿菌被殺死。隨之乳酸生成減少，陰道內的酸性環境也就被破壞，各種致病菌就會乘虛而入，在陰道內大量繁殖，引起多種婦科疾患。尤其是婦女絕經以後，由於卵巢功能減退，陰道粘膜變薄，陰道桿菌已相對減少，濫用高錳酸鉀更容易誘發老年性陰道炎。
使用高錳酸鉀水溶液坐浴治療陰道炎也應按不同情況分別對待。對於由葡萄球菌、鏈球菌、大腸桿菌和變形桿菌等細菌感染引起的陰道炎和滴蟲性陰道炎，都可以用高錳酸鉀水溶液坐浴作爲輔助治療。因爲這些病原微生物不適宜在酸性環境中生長，容易被高錳酸鉀殺滅。而黴菌性陰道炎主要是由念珠菌引起，這種黴菌平時可在陰道中寄生。在機體抵抗力降低或長期大量應用廣譜抗生素等藥物時，念珠菌會因菌羣紊亂而迅速繁殖，從而導致陰道炎的發生。
不要長期使用高錳酸鉀，以免陰道里的菌羣紊亂。使用高錳酸鉀還應注意，由於高錳酸鉀放出氧的速度慢，浸泡時間一定要達到5分鐘才能殺死細菌。配製水溶液要用涼開水，熱水會使其分解失效。配製好的水溶液通常只能保存兩小時左右，當溶液變成褐紫色時則失去消毒作用。故最好能隨用隨配。
