潰瘍性結腸炎如果不及時診斷，可能會引起多種併發症。常見併發症有
1、腸穿孔:多爲中毒性腸擴張的併發症，也可發生在重症型中。皮質激素的應用被認爲是腸穿孔的危險原因。
2、中毒性腸擴張:這是本病的重症併發症，多發生在全結腸的患者，死亡率達到44%。臨牀症狀是腸道高度擴張，伴有中毒症狀，腹部明顯膨脹，最明確的擴張部位是橫結腸，體檢腹部有壓痛和跳躍疼痛，腸鳴聲明顯減弱或消失。
3、大量便血:便血是本病的主要臨牀症狀之一，便血的數量也是衡量病情的重要指標，但絕對難以定量。這裏所說的大量便血是指短時間內大量腸出血，伴隨着脈搏加快、血壓下降、血色素下降，需要進行輸血診斷。
4、腸狹窄：多發生在病變廣泛、病程持續、長達5-25年以上的病例，其部位多發生在左半結腸、乙狀結腸或直腸。其原因是粘膜肌層的增厚，假息肉堵塞腸腔。臨牀上一般沒有症狀，嚴重時腸道堵塞。
5、結腸癌：眼前已共認潰瘍性結腸炎併發結腸癌的機會要比同年齡和性別組的一般人羣分明爲高，一般以爲癌變趨勢和病程是非有關，病程15-20年後，癌變的危險性大約每年增加1%。中國人的發生率很低。對於潰瘍性結腸炎病程在10年以上者要注意癌變的可能。
