低鎂血癥的患者在發病初期，或者說美元素缺乏量不是很大的前期，患者不會有什麼明顯的症狀，這一特性也非常容易使疾病延誤治療。持續的鎂元素流失會讓患者逐漸的顯現出很多明顯的症狀。但是低鎂血癥症狀雖然明顯，卻並非特異性的症狀，所以有時候低鎂血癥在臨牀上也難以識別。
一、神經肌肉。低鎂血癥患者神經肌肉上出現的症狀比較多。比如經常感到肌肉軟弱無力，肌肉抽筋，肌肉震顫等等，患者還會有共濟失調，懸暈表情，冷漠的表現。人們在缺鈣的情況下有時也會出現這些症狀，所以有很多患者很自然的會把這些症狀當成是缺鈣。
患者的肌膚再受到刺激後會產生或亢進或遲鈍的表現，吞嚥功能也會受到影響，容易發生驚厥和昏迷，精神情緒方面的症狀比較複雜多樣，甚至會喪失方向感。
二、心臟。鎂元素之所以被稱爲“心血管衛士”。是因爲它對心臟血管能起到保護作用，在缺乏鎂元素的情況下心臟也會自然表現出很多症狀，如心律失常，心跳過快，心室纖顫、心衰等等，甚至會導致患者猝死。
三、代謝方面症狀。碳水化合物在人體代謝的過程中會產生厭氧及有氧代謝能量，而這些能量的產生必須有鎂元素參與。當人體缺乏鎂元素時會造成糖耐量異常，由於人體代謝異常，就容易導致動脈粥樣硬化。
