腦幹梗塞已經引起醫療工作者的廣泛關注，對於這種疾病的檢測也有多種方式。
首先，腦栓塞。起病急驟，數秒鐘或數分鐘內症狀達到高峯，常有心臟病史，特別是心房纖顫、細菌性心內膜炎、心肌梗死或其他栓子來源時應考慮腦栓塞。
其次，腦出血。其發病更急，數分鐘或數小時內出現神經系統局竈定位症狀和體徵，常有頭痛、嘔吐等顱內壓增高症狀，以及不同程度的意識障礙，血壓增高明顯。但大面積腦梗死和腦出血，以及輕型腦出血與一般腦血栓形成症狀相似。可行頭顱CT以鑑別。
最後，顱內佔位。某些硬膜下血腫、顱內腫瘤、腦膿腫等發病也較快，出現偏癱等症狀及體徵，需與本病鑑別。可行頭顱CT或MRI鑑別。
