很多人購買淨水器後發現淨水器也是要定期清洗的，但又對清洗淨水器的方法一知半解，於是認爲清洗是一件麻煩事，其實，只要用對方法，清洗也可以很簡單。
加壓過濾法
懶人一般都不想親自動手清洗淨水器，最簡單的方法就是購買專業的家用淨水器清洗機器，將清洗機的兩端分別接入淨水器的入水口和排水口，形成閉環，倒入專用消毒液，按下啓動鍵，就能解決清洗問題。
臭氧殺菌法
臭氧具有殺菌的功效，可用於清潔淨水器。清洗時，切斷電源，排盡餘水，然後注入臭氧燻蒸20分鐘，並注入水再重新把水倒掉。一般，臭氧幾個小時內能殺滅全部細菌，但不能清除掉水垢等雜質，所以，清洗時還要注意除雜質。
藥片、消毒劑清洗法
去污泡騰片是清洗淨水器時常用的，因爲去污泡騰片經水分解後能有效殺滅病菌，所以，如家中有去污泡騰片，也可以用它來清洗淨水器。但需注意的是，清洗後要用水沖洗乾淨內膽，避免造成二次污染，這樣才能喝到安全放心水。
