艾草薰香對人體沒有明顯的害處，主要是藉助熱力和藥效，對穴位或者病變部位進行刺激，以達到防治疾病的作用。
艾草薰香具有祛除體內寒氣的功效，可以促進血液運行，具有溫陽與補益的作用，可以在一定程度上消除體內瘀血、緩解疼痛。
如果是陰虛陽亢之人或者陽盛體質之人，長時間使用艾草薰香，可能會出現口舌乾燥、口舌生瘡、小便短赤、大便祕結等上火表現。如果操作不當，可能會灼傷局部皮膚，導致局部紅腫、水泡、皮膚瘙癢等症狀。因此，陰虛陽亢、陽盛體質之人慎用艾草薰香，孕婦、皮膚病患者、呼吸系統疾病患者、對艾草薰香過敏者禁用。
此外，艾草薰香只有輔助治療的效果，如果身體不適，需立即就醫，結合自身情況，由醫生制定合適的方案進行治療。
