癲癇是一種神經系統的慢性疾病，長期病程中癲癇的反覆發作對人體健康會造成一定的危害，其危害程度與癲癇病的嚴重程度有關，包括髮作頻率、持續時間、病史長短、臨牀表現、心理素質等方面。一般來說發作頻率越高、發作持續時間越長、病程越長、臨牀表現越複雜、心理素質越差則危害越大，預後越差。
癲癇發作可使正常的神經細胞受到傷害，膠質細胞增生以及體內其他器官生化環境的改變，主要對癲癇患者產生的影響包括大腦損傷、對行爲的影響、對壽命的影響、對其他組織器官造成的傷害。
癲癇是很危險的，一旦癲癇發作，可以突然意識喪失而摔倒在地，造成腦部或其他部位損傷，而且癲癇發作時可以造成呼吸暫停，引發腦細胞缺氧、水腫，也可能加重腦細胞的損傷。腦細胞受到損傷後，不但可以導致記憶力下降、性格改變、反應遲鈍，還可以使癲癇發作更加頻繁。一些病程較長的癲癇患者可以出現行爲怪異，少言寡語、性格孤僻、易激惹、多疑等。癲癇發作常很突然，容易造成患者的意外傷害，甚至危及生命，部分患者癲癇發作呈持續狀態，容易導致併發症而危及生命。部分患者在癲癇發作時呼吸、血壓、心率會受到影響，其他組織器官也會受到一定的傷害。
