一般情況下，肝囊腫與肝癌可以通過發病性質、症狀、人羣、體徵等方面來鑑別。具體分析如下：
1.發病性質：肝癌是在肝臟當中出現的惡性腫瘤，臨牀當中會通過肝癌發病的部位來區分原發性肝癌以及繼發性肝癌。一般來說肝癌患者的治療時間比較長，並且在進行檢測的時候，需要通過CT檢查來確診。而肝囊腫雖然也是在肝臟部位出現，但它是屬於良性的病變。患者可以根據其發病的原因來進行治療。通過CT檢查，其密度是比較低的，而肝癌的密度則是比較高的。
2.症狀：患者只有當肝囊腫增大到一定程度以後，囊腫會對鄰近的器官進行壓迫，纔會感到右上腹部出現不舒服或隱隱作痛的感覺，在吃飽飯以後會有肚子發脹的狀況。在平時是沒有明顯的症狀出現。而患有肝癌的患者則容易出現肝區疼痛、排黑便、出現黃疸的狀況。
3.人羣特徵：肝囊腫一般是先天性發病，男女之間發病並沒有明顯的特徵，可以在任何的年齡段當中出現。而肝癌的發病一般是在中老年人當中，男性發病的概率比女性要更高。
4.體徵：患者出現肝囊腫以後沒有明顯的體徵出現，一些體積較大的囊腫患者可以在肝區觸摸到沒有疼痛感的囊性包塊，會感覺到肝區腫大。而肝癌的患者在對肝區進行觸摸的時候，會有堅硬的硬塊出現，並且還會有肝硬化的一些特徵的出現。
