生化妊娠與自然流產，在症狀、是否成功着牀、對於女性身體影響均有不同。生化妊娠危害性不大，但自產流產卻嚴重影響身體健康。
1.症狀表現不同
生化妊娠一般不會出現特殊的表現，與月經類似。然而，少數女性可發現陰道有一層灰白色的膜流出。而自然流產首先是陰道出血，其次是腹痛，大多有很強的腹痛反應。
2.受精卵是否着牀
生化妊娠是受精卵沒有成功着牀，一般不會影響女性身體健康，不需特殊處理。但自然流產，是胚胎成功的着牀，沒有成功發育，且流產後要檢查是否流產乾淨。
3.危害不同
一般來說，生化妊娠與女性月經延遲相似，對女性造成的影響不大。自然流產對女性健康有重大影響，特別是在流產後，導致出血、子宮感染，甚至影響生育。
