HPV病毒通常不會引起眼睛部位的感染，可以通過相關檢查來確定病因。如果存在細菌感染，可以應用抗生素類的外用藥治療；如存在HPV病毒感染，可使用抗病毒藥物治療。
HPV也就是人乳頭瘤病毒，這種病毒有多種傳播途徑，主要是性傳播，常見的感染部位爲生殖器官，也可能會感染其他部位的皮膚和黏膜，比如腋下、口腔等，一般不會感染眼睛，但也不能完全排除這種可能性。如果在HPV病毒感染期間出現眼睛不適，需及時就醫進行眼部分泌物HPVDNA檢測，也要進行眼部的病原體檢測，如細菌、沙眼衣原體等，確定引起眼睛不適的具體原因。
通過相關的檢查後找到具體的發病原因，可根據病因採取相應的治療措施。細菌感染可以應用抗生素類的眼藥膏或眼藥水，如紅黴素眼膏、妥布黴素地塞米松滴眼液、左氧氟沙星滴眼液等。懷疑有HPV病毒感染，可以配合應用抗病毒的藥物治療，如利巴韋林片、重組人干擾素α-2b注射液、阿昔洛韋片等。
