埃博拉病毒無特效藥物治療，但可通過服用抗菌、抗病毒藥物，延緩病情發展，如單克隆抗體、法匹拉韋、瑞德西韋等。
埃博拉屬於急性傳染病，多數患者預後情況較差，治療需採取綜合救治措施。目前尚無有效抗病毒和抗菌藥物治療，但通過世界衛生組織推薦，緊急情況下，臨牀可使用單克隆抗體、法匹拉韋、瑞德西韋等抗病毒藥物。
若有繼發細菌感染症狀，需先加強細菌學檢查，並在醫生指導下服用抗菌藥物治療，必要時，需採取抗炎保肝、抗凝止血治療。
