肛門指檢是醫生將帶有無菌手套的手指伸進肛門以檢查疾病的一種簡便易行卻非常重要的檢查方法，是早期腸癌的主要篩檢方法。
我國國內的一項統計表明，80%以上的直腸癌患者做肛門指檢時可發現病變，若採取左臥位可捫及更高部位的癌腫;大腸癌中約50%患者可通過簡單的肛門指檢初步確立診斷，甚至一些有便血、便頻、黏液便及裏急後重等排便習慣不正常的患者都應進行肛門指檢。
肛門指檢操作簡單，可查到距肛緣7～10釐米的肛門、直腸有無病變和病變的性質，如果叮囑患者做屏氣等增加腹壓的動作，還可查到更高部位的病變。
做肛門檢查時，醫生應先將示指輕按肛門後壁以解除患者因放射性肛門括約肌收縮而引起的不適感，然後再讓患者深呼吸。
直腸癌多數摸起來呈扁平狀、質硬、橢圓形或環形、邊緣隆起而中央凹陷的潰瘍，有時爲突入腸腔的菜花狀堅硬腫塊。男性直腸癌檢查時注意與前列腺的關係，女性注意與陰道後壁的關係，當癌腫表面易發生潰爛時指套上常染有血液和黏液。
肛門指檢陰性的患者，如果同時有其他不適症狀應進一步做大便潛血試驗，必要時做X線、內鏡檢查。肛門指檢陽性者應做內鏡、細胞學或活取性組織作進一步病理學檢查。
