男性不育是一種原因較爲複雜的生殖系統疾病，需與以下幾種睾丸疾病認真鑑別，以免因誤診而耽誤疾病的早期最佳治療時機。
1、與先天性睾丸畸形和發育不良性疾病相鑑別
通過細胞遺傳學檢查以及性激素水平檢查等鑑別診斷措施，對男性不育和先天性睾丸畸形和發育不良性疾病認真區別很重要。
先天性睾丸畸形和發育不良性疾病主要包括3類，即隱睾症、先天性兩性畸形、無睾症。所謂隱睾症，即指睾丸在下降過程中滯留在某一處而未正常降入陰囊或出現睾丸異位現象；而先天性兩性畸形主要是由於染色質和染色體組型異常導致的，患者既有男性性腺又有女性性腺特徵；無睾症患者的主要表現爲無青春期發育特徵以及無第二性徵。
2、與睾丸損傷相鑑別
找出男性不育的原因是疾病治療的關鍵，在診斷過程中應注意與睾丸損傷相鑑別，並及時給予對症治療，以免因睾丸損傷影響男性生育功能。
睾丸損傷主要包括2類，即有明顯外傷的睾丸損害以及精索扭轉導致的睾丸損傷。其中精索扭轉的原因與嚴重鞘膜積液和精索靜脈曲張有關。
