事實上，葡萄胎的真正發病原因不明。病例對照研究發現，葡萄胎的發生與營養狀況、社會經濟及年齡有關。病因學中年齡是一顯着相關因素，年齡大於40歲者葡萄胎髮生率比年輕婦女高10倍，年齡小於加歲也是發生完全性葡萄胎的高危因素，這兩個年齡階段婦女易有受精缺陷。部分性葡萄胎與孕婦年齡無關。
1、完全性葡萄胎：胎盤絨毛全部受累，無胎兒及其附屬物，宮腔內充滿水泡;就算只有1只精蟲進入卵子也可能會發生問題，若是媽媽的卵子是個“空包蛋”，就會造成染色體異常，因爲只有爸爸的染色體不斷的在進行分裂，也會造成滋養層不斷增生，卻沒有胎兒的情形。同樣的，若是2只精蟲同時進入空卵，也會發生這樣的情形。這種情況稱之爲完全性葡萄胎。
完全性葡萄胎可能與地域、種族、營養、社會經濟因素及妊娠年齡等因素有關。
(1)飲食中缺乏維生素A及其前體胡蘿蔔素和動物脂肪者發生葡萄胎的機率顯着升高。
(2)年齡是另一高危因素，大於35歲和40歲的婦女妊娠時葡萄胎髮生率分別是年輕婦女的2倍和7.5倍。相反，小於20歲婦女的葡萄胎髮生率也顯着升高。
(3)前次妊娠有葡萄胎史也是高危因素，有過1次和2次葡萄胎妊娠史者，再次葡萄胎的發生率分別爲百分之一和百分之十五到二十。
2、部分性葡萄胎：葡萄胎有一種情況，就是因爲同時有2只精蟲進入到卵子裏，無法發展出正常的胎兒，但是滋養層細胞卻持續的增長。這樣便會造成初期的胎兒與過度增長的滋養層細胞，同時存在於子宮中，僅部分胎盤絨毛髮生水泡狀變性，宮腔內尚有存活或已死的胚胎。在自然流產的組織中發現百分之四十病人有一定的水泡樣變性，但不診斷爲葡萄胎。
部分性葡萄胎可能與使用口服避孕藥及月經失調有關。但和年齡及飲食因素無關。不論是完全性還是部分性葡萄胎，多餘的父源基因物質是造成滋養細胞增生的主要原因，極少數部分性葡萄胎的核型爲四倍體，但其形成機制尚不清楚。
