少部分咽峽炎可自愈，大部分咽峽炎需進行積極治療才能好轉。
有些急性咽峽炎病情較輕，並沒有很明顯臨牀症狀，僅只是感覺咽喉部位輕微不適，沒有影響正常進食，且沒有引起鼻竇炎等其他疾病。這時要多喝水，且多注意休息，保證清淡飲食，多吃新鮮蔬果，病情可能會自行好轉或痊癒。
如果咽峽炎發病後症狀不斷加重，出現畏寒、發熱、頭痛及明顯咽喉疼痛等現象，或引起其他疾病，很難自行好轉或痊癒，需及時進行治療，防止病情加重。如果演變成慢性咽峽炎，多數情況下無法自愈，治療難度也會增加，需及時進行診治，日常生活中也要多注意護理，防止病情加重或反覆發作。
