慢性肝炎的危害可以說是非常嚴重的。有可能會誘發諸如腹水、上消化道出血以及肝昏迷這些不良症狀的出現，對於患者的生活質量影響特別大。而且，一旦病情得不到有效的控制，就會誘發諸如肝硬化，甚至是肝癌等嚴重後果。
每年會有3％至5％的患者會出現肝硬化，其併發症有：腹水，上消化道出血和肝性腦病（也稱爲肝昏迷），肝硬化併發症患者也稱之爲失代償性肝硬化。如果患者病情得不到有效控制，5年生存率僅爲14％至35％。換句話說，慢性乙型肝炎發展爲失代償性肝硬化後，60％的患者每5年會死於肝硬化併發症。
對於未進展爲肝硬化的慢性乙型肝炎患者，肝癌的年發病率爲0.5％至1.0％。乙型肝炎肝硬化患者每年肝癌發病率高達3％至6％。早期肝癌大多無症狀，可在定期檢查中發現。如果發現直徑小於3釐米並且是單發的，可以通過手術治癒。
然而，肝癌是一種快速惡化的惡性腫瘤。一旦出現症狀，那麼患者就失去了治癒的機會。症狀發作至死亡的平均時間爲3-6個月。換句話說，晚期肝癌的平均生存時間不到半年。
事實上，正由於慢性肝炎這種疾病是無法治癒的，而且還有惡化成爲肝硬化以及肝癌的巨大風險。所以，治癒並不是慢性肝炎所需要設定的治療目標；就算設定了這個治療目標也是毫無意義的。治療慢性肝炎，目的就是通過藥物來控制病情，朝着肝硬化以及肝癌這兩條不歸路發展。一旦惡化成了肝硬化，那麼就要通過藥物來延緩以及減輕肝硬化所誘發的不良症狀；而一旦惡化成了肝癌這種嚴重後果，那麼治療目標就是提高患者的生活質量，同時延長患者的生命時間。
