白塞病的治療通常以藥物治療爲主，服藥時間長短不同。許多患者需要長期服藥，主要是免疫調節藥和免疫抑制藥，包括外用藥、口服糖皮質激素、甲氨蝶呤、替麥考酚酯和抗腫瘤壞死因子困難劑等。白塞病的具體藥物治療方法詳細介紹如下:
1、苯丁酸氮芥(CB1348):用於視網膜、中樞神經系統和血管病變，用法爲2mg3/d，持續使用數月，直到病情穩定，然後逐漸減少到少量維持但是部損傷應考慮用藥2-3年以上，以免復發。
2、硫唑布丁(Azathioprine):用量爲2~2.5mg/kg/d，可抑制口腔、眼病和關節炎，但停藥後易復發，可與其他免疫抑制劑聯用。
3、甲氨蝶呤(Methotrexate):每週7.5~15mg，口服或靜注藥，用於治療神經系統、皮膚粘膜等病變，可長期小量服用。
4、環磷酰胺(Cyclophosphamide):急性中樞神經系統損傷或肺血管炎、眼炎時，可與潑尼鬆共同使用，口服或大量靜脈衝擊治療(每次使用量爲0.5~1.0/㎡體表面積，每3~4週一次)
