不同類型息肉病因不同，炎性息肉是腸粘膜受長期炎症刺激增生的結果，錯構瘤型息肉具有家族遺傳傾向。
1、長期腹瀉
很多患者腸道粘膜容易過敏。例如，飲酒、吃辣椒、油膩的食物或海鮮後腹瀉，有些患者無緣無故腹瀉，腸道粘膜慢性炎症，腸道息肉容易成長。
2、長期便祕
便祕的病人經常是幾天排便一次，糞便長期在腸道內儲存會產生各種毒素，導致腸黏膜出現慢性炎症，易 生長息肉。
3、飲食性因素
長期飲食高脂肪、高蛋白、低纖維性飲食者直腸息肉的發生率明顯提高，新鮮水果蔬菜和維生素c者的息肉的發生率減少。
4、膽汁代謝紊亂
胃十二指腸潰瘍行胃空腸吻合和膽囊切除術後患者，膽汁流動和排出時間發生變化，腸內膽汁酸含量增加。實驗顯示膽汁酸以及膽汁酸的代謝產物脫氧膽酸和石膽酸均有誘發結直腸黏膜產生腺瘤性息肉或癌變的作用。
5、遺傳
例如家族性息肉病就是一種遺傳疾病。
6、腸道炎性疾病
結腸黏膜的慢性炎症病變是導致炎症性息肉發生的主要原因，最多見於慢性潰瘍性結腸炎、克羅恩病以及阿米巴痢疾、腸道血吸蟲和腸結核等，也見於結腸手術後吻合口部位。
