基礎體溫是指清晨醒後，在未作任何活動前即將體溫表置於舌下(不宜放腋下或肛門測溫)5分鐘所測得的體溫。如值晚夜班者，下班後睡眠4～6小時測溫，並在記錄單上註明夜班後測溫。起牀時間相差1小時以上時，可影響基礎體溫的測定。
對於精神極度緊張的不孕婦女，過多地強調測量時間的準確性會加重其思想負擔，因此，可採取在記錄基礎體溫旁註明測溫時間的辦法，一般睡眠時間不會明顯影響基礎體溫的測定，但最好能保證睡眠時間在6～8小時左右。
此外，每晚臨睡前應將體溫計水銀柱甩至35℃以下，放在枕邊備用。
基礎體溫的測量，是不孕症患者提供給醫師診斷治療的依據之一。將連續測得的體溫記錄於基礎體溫單(表格)上，連成一條曲線，記錄單除記基礎體溫外，還應記錄性生活日期，有無感冒、發熱或遲睡以及月經週期內下腹隱痛、陰道點滴出血、白帶增多等情況。因正常生育婦女也不是每個月經週期都排卵，所以必須連續測3個週期或更長時間的基礎體溫，才能判斷有無排卵功能。
