智能熱馬桶可以促進排便，但效果有限，嚴重便祕還需應用藥物治療。
現在智能馬桶大都有加熱的功能，坐在加熱的馬桶上排便，適宜的溫度會促進肛門和直腸周圍的血液循環，還可能影響到腸壁，導致腸道蠕動加快，可縮短糞便在腸道內滯留時間，大便水分未被腸壁大量吸收，大便較軟，排便較順暢。在排便時用溫水沖洗肛門，能軟化大便，按摩肛門周圍的強中穴等穴位，也能刺激腸道蠕動，對於順利排便有一定的幫助。坐在熱馬桶上，還能刺激肛門括約肌，促進腸道、尿道的收縮、舒張能力，排便、排尿等會更順暢。
但熱馬桶促進排便的效果有限，如有嚴重的便祕症狀，單純依靠熱馬桶刺激排便，可能還會存在排便困難的情況，可服用麻仁潤腸丸、車前番瀉顆粒、蘆薈膠囊等藥物潤腸通便，熱馬桶只能輔助排便。具體用藥需遵醫囑，不可擅自用藥。
