女性腎感染的原因，主要是細菌從膀胱上行感染腎臟導致的，和女性的尿道解剖特點關係密切，也可能是因爲不注意個人衛生造成的。
女性發生腎感染，通常與尿道解剖特點有關。女性的尿道短、寬、直，細菌容易逆行進入尿道以及膀胱當中，還會繼續上行感染，經輸尿管到達腎臟。常見的是細菌感染，如大腸桿菌、糞腸球菌、葡萄球菌、綠膿桿菌等，極少數是由真菌、病毒或者其他微生物感染引起的。
女性的肛門以及生殖器距離尿道非常近，如果平時不注意這兩個部位的清潔，容易出現相互感染。肛門以及生殖器部位的細菌會進入尿道當中，細菌上行後會進入腎臟當中造成腎臟感染。若平時不注意會陰部的清潔衛生，無法做到每日清洗，內褲也不能經常換洗，或者大便後有不良的擦拭習慣，也會給細菌逆行感染提供可乘之機。
