對青少年型牙周炎的病因雖然尚未完全明瞭，但對本病病因的研究是目前牙周病學領域最廣泛和深入的課題之一。已能肯定微生物和機體防禦能力的缺陷是引起本病的兩個主要因素。
1.微生物 青少年型牙周炎病變部位的齦下菌斑較薄(20～200μm)，一般不鈣化，以非附着菌斑爲主，放線共生放線桿菌(nomycetemcomitans)和嗜二氧化碳噬纖維菌(Capnocytophaga)被認爲是青少年型牙周炎的主要可疑致病菌，但青少年型牙周炎的齦下菌羣極爲複雜，各家報道也有差異。近年來有人提出假設，認爲放線共生放線桿菌可能是最初發病時的主要致病菌，一旦疾病成立和加重後，牙周袋加深，炎症加重，齦下的生態環境改變，使一些嚴格厭氧菌如類桿菌、艾肯菌、具核梭桿菌等成爲優勢菌，伴放線桿菌不再佔主導。實際上，上述細菌都是口腔內的常駐菌，只是由於菌斑生態環境或機體條件的改變，使它們之間的比例發生變化。
2.全身背景 已有大量研究證明，青少年型牙周炎患者有外周血中性多形核白細胞趨化功能異常，這種缺陷帶有家族性。
