在人類乳頭瘤病毒感染的早期或尖銳溼疣邊緣，看上去仍是正常的皮膚和黏膜，顏色正常，並不高於黏膜表面；但從組織學上進行觀察，已有人類乳頭瘤病毒的病理改變，這種情況就叫做尖銳溼疣的亞臨牀感染。
通常情況下，尖銳溼疣亞臨牀感染常分三種類型：
①微小無蒂疣，主要見於陰莖、大陰脣外側的皮膚乾燥部位，常爲單個或若干個，1～3毫米直徑大小，常見病毒爲HPV-16 型，若皮損太小，常被忽視，應該用放大鏡觀察。
②微小乳頭狀隆起，可見於女陰前庭及陰道內。一般多發，呈乳頭狀或絨毛狀隆起，或融合成顆粒狀外觀。病變泛發或侷限，與HPV-6型感染有關。
③外觀正常的環狀皮損，可見於陰莖，女性外陰、陰道和子宮頸。早期用醋酸白試驗才能看到，在放大鏡下更明顯。可能是HPV-16型感染所致。尖銳溼疣亞臨牀感染的存在是尖銳溼疣複發率高的一個重要原因。同時，這些病人患處肉眼所見不到的疣體，可數年無症狀而成爲帶病毒者，通過性接觸更易感染他人，因而應該引起足夠重視。
