一般情況下，非典型增生與複雜增生差不多，但是比複雜增生嚴重，有些病例有發展至癌症的可能。在嚴重不典型增生中，癌變率也是很高的，所以需要引起重視。具體分析如下：
這種類型的增生只會發生在子宮內膜腺體，腺上皮細胞的異型性是診斷的關鍵。病變部位呈局竈性或多竈性分佈，病變部位中也可以見到正常、萎縮或其他類型增生的腺體。病竈的腺體增加，間質減少。增生腺體不僅輪廓不規則，而且具有腺體上皮細胞異型性，即極性紊亂或細胞排列消失，細胞核增大變圓，呈不規則狀態，核仁明顯，細胞質富含嗜酸性粒細胞。
伴有間質纖維化的非典型增生可以看作是息肉樣腺肌瘤樣或息肉狀息肉狀腺瘤，易被誤診爲癌的肌層浸潤。在顯微鏡下它應該有明顯的間質浸潤和差的分化，最好不要僅通過刮宮來診斷子宮肌層浸潤。
