隨着醫療水平的增加，目前很多治療甲亢的方法都很有效，選擇合適的治療方法是治療效果好壞的關鍵。
1、藥物治療：藥物治療是甲亢的基礎治療，正規治療一個療程約爲2年左右。患者需要反覆查血常規和肝腎功能，且在甲狀腺功能結果沒有達到正常之前，每月需要複查甲狀腺功能，正常後仍需3個月複查一次。藥物治療甲亢具有應用普遍、有效、靈活、便宜等優點，但是藥物治療療程長，易復發，少數會引起粒細胞缺乏症和肝功能損傷的副作用。
2、手術治療：手術治療可以治癒70～90%的甲亢患者，手術治療適合於年輕患者，也適合於甲狀腺顯着增大及對抗甲亢藥物過敏或有嚴重副作用者。但會有 10～30%患者需要第二次手術，手術治療也可引起甲狀腺功能減退症，而必須服用甲狀腺激素替代治療。
3、放射性碘-131治療：放射性碘-131有很高的選擇性，進入人體內後幾乎只被甲狀腺所攝取，其發射的射線破壞一定量的甲狀腺細胞，適用年齡有限，造成甲減的機率很高，10%的病患是終身甲減。
除此之外，甲亢患者還可以選擇介入治療、中醫治療等方法，應根據自身體質及病情發展選擇。
